curso: proteínas dúctiles y sus aplicaciones

Hola,

hoy quiero difundir un curso de verano de 3 días, que dirigen nuestras colegas Inma Yruela y Patricia Ferreira, "Nuevos Retos en Biología Molecular: las proteínas dúctiles y sus aplicaciones".

Tendrá lugar en Jaca del 11 al 13 de julio, y participamos varios profesores invitados. Hay 4 bolsas de viaje disponibles. Más información en la dirección:

https://cursosextraordinarios.unizar.es/curso/2018/nuevos-retos-en-biologia-molecular-las-proteinas-ductiles-y-sus-aplicaciones

(cartel actualizado 02052018)

Hasta pronto,
Bruno

PD: el enlace al material que usaremos en mi sesión es http://www.eead.csic.es/compbio/material/alineafilog

Congreso BIFI2014 y taller internacional de bioinformática

Hola,

la próxima semana el laboratorio estará en dos eventos simultáneos:

http://bifi.es/events/bifi2014

http://congresos.nnb.unam.mx/TIB2014

1) los Talleres Internacionales de Bioinformática TIB2014, donde Carlos Pérez Cantalapiedra participa como profesor en el "Taller 2: Bioinformática para análisis de datos de secuenciación masiva (NGS)". Este evento tiene lugar en el campus UNAM en Cuernavaca, Morelos, México. Aprovecho para señalar que, entre otras muchas herramientas y utilidades para el manejo de datos NGS, Carlos empleará dos programas desarrollados en el laboratorio, uno escrito en C++ y otro en Perl:

•  split_pairs: efficient kseq-based program to sort and find paired reads within FASTQ/FASTA files, with the ability to edit headers with the power of Perl-style regular expressions
•  split_blast: Perl script to take advantage of multi-core CPUs for doing BLAST searches that fit in RAM, del que ya hablamos en este blog

2) la IV International Conference BIFI 2014, en Zaragoza, España, donde el laboratorio presenta varios pósters y una charla sobre trabajo reciente.

Nos vemos allí, un saludo,

Bruno

Tutorial en el congreso BIFI2013

Hola,
nuestro laboratorio (www.eead.csic.es/compbio) coordinará un tutorial el viernes 1 de Febrero a las 15.00 horas como parte del congreso BIFI 2013. El título es:

Taller de análisis bioinformático de proteínas reguladoras

Resumen: En este taller veremos cómo estudiar por medio de herramientas bioinformáticas propiedades de las proteínas reguladoras, como las regiones intrínsecamente desordenadas, su interfaz de reconocimiento de ADN y la predicción de posibles elementos cis.

Duración: 2 horas

Cómo llegar: http://goo.gl/maps/RFJmj 

Un saludo,
Bruno

PD Un artículo nuestro reciente donde estudiamos el desorden en plantas: http://www.biomedcentral.com/1471-2229/12/165

BIFI 2012 - V Congreso Internacional - Dianas proteicas: Descubrimiento de Compuestos Bioactivos

Del 1 al 4 de febrero de 2012 se celebrará en Zaragoza la 5º Congreso Internacional del Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos (BIFI).

Este año el tema central será el Descubrimiento de Fármacos, cubriendo desde los pasos iniciales de investigación en laboratorio hasta los estudios preclínicos: nuevas dianas proteicas, validación de dianas, nuevas metodologías y herramientas de caracterización tanto estructural como funcional y cribado computacional de moléculas. La conferencia servirá de punto de encuentro de investigadores del campo del descubrimiento de fármacos, donde se discutirán los avances más recientes y retos futuros.

Nuestro laboratorio asistirá al evento con un seminario titulado "Protein-DNA interface prediction techniques: performance and potential in protein engineering" y un póster titulado: "In vivo DNA binding pattern of Rex-1 in mouse embryonic stem cells" realizado en colaboración con el Departamento de Veterinaria de la Universidad de Zaragoza.

English version:

The V International Conference of the Institute for Biocomputation and Physics of Complex Systems (BIFI) on February 1-4, 2012.

The meeting will be an international conference on Drug Discovery from a protein perspective, covering most of the initial steps in drug discovery and preclinical studies (new protein targets, protein target validation, new methodologies and tools for structural and functional characterization, experimental and computational high-throughput screening, etc.). We wish the conference to represent a venue for gathering active researchers on drug discovery, with strong roots in the scientific and academic communities to discuss recent developments and future challenges in the field.

Our laboratory will participate in the event with a talk titled "Protein-DNA interface prediction techniques: performance and potential in protein engineering" and a poster titled: "In vivo DNA binding pattern of Rex-1 in mouse embryonic stem cells" in collaboration with the Veterinary Department of the University of Zaragoza.