más one-liners Perl

Hola,
antes de que se acabe el año aprovecho para compartir con vosotros un excelente tutorial de one-liners de Perl, esos comandos que en una línea permiten ejecutar complejas operaciones en el terminal de Linux, el símbolo del sistema de Windows, o, mejor aún, desde dentro de una ventana de MobaXterm.
El tutorial se aloja e:

https://github.com/learnbyexample/Command-line-text-processing/blob/master/perl_the_swiss_knife.md

y tiene ejemplos tan útiles como:

# 1) calcula máximo de una lista de números separados por comas

$ echo '34,17,6' | perl -MList::Util=max -F, -lane 'print max @F'
34

# 2) valida y expande un one-liner a un programa completo más comprensible

$perl -MO=Deparse -ne 'if(!$#ARGV){$h{$_}=1; next} print if $h{$_}'
LINE: while (defined($_ = )) {
    unless ($#ARGV) {
        $h{$_} = 1;
        next;
    }
    print $_ if $h{$_};
}
-e syntax OK

El tutorial tiene también recetas para usar el resto de herramientas del terminal Linux, como grep, sed y muchas otras, en

https://github.com/learnbyexample/Command-line-text-processing

Feliz año!
Bruno

apuntes de python científico

Me envía mi colega Daniel Bellomo de la UNRC, en Argentina, un enlace a una recopilación de material didáctico que están usando los alumnos de Químicas para aprender a ser autónomos en cálculo científico con software Open Source, iniciativa que apoyamos y por eso difundimos también aquí:

La idea básica es que los alumnos puedan usar python para sus trabajos
diarios y dejen de usar herramientas con licencias pagas (matlab,origin, etc).
Éste es el  temario, y los ejercicios están en el link al final de la pág:
https://github.com/pewen/cpc

Abrazo,
Daniel

Tutorial en el congreso BIFI2013

Hola,
nuestro laboratorio (www.eead.csic.es/compbio) coordinará un tutorial el viernes 1 de Febrero a las 15.00 horas como parte del congreso BIFI 2013. El título es:

Taller de análisis bioinformático de proteínas reguladoras

Resumen: En este taller veremos cómo estudiar por medio de herramientas bioinformáticas propiedades de las proteínas reguladoras, como las regiones intrínsecamente desordenadas, su interfaz de reconocimiento de ADN y la predicción de posibles elementos cis.

Duración: 2 horas

Cómo llegar: http://goo.gl/maps/RFJmj 

Un saludo,
Bruno

PD Un artículo nuestro reciente donde estudiamos el desorden en plantas: http://www.biomedcentral.com/1471-2229/12/165