28 de abril de 2022

Gabriela y la dinámica molecular

Hola,

esta mañana leía sobre el descubrimiento de que una mutación en el gen TLR7 es suficiente para causar lupus eritematoso sistémico (LES), una enfermedad autoinmune. La mutación es la sustitución Y264H, deletérea según los programas SIFT y CADD (ver otras opciones aquí), de la que es portadora Gabriela, una chica madrileña. 

El artículo completo está en https://doi.org/10.1038/s41586-022-04642-z , yo quería simplemente destacar parte de la primera figura:

Adaptada del original en https://doi.org/10.1038/s41586-022-04642-z

En el alineamiento múltiple de arriba se puede ver que la tirosina Y264 está muy conservada en animales, y por eso SIFT le asigna una puntuación de 0.12 al cambio por histidina (otras dos mutaciones no sinónimas tienen puntuaciones de 0.05 y 0). 

El panel del medio muestra la unión del ligando guanosina al receptor silvestre TLR7 (Y264) y el de abajo con el receptor mutado, donde se ve que se libera volumen que ocupan varias moléculas de agua, aumentando a la vez la afinidad por la guanosina.

Este análisis fue posible por la disponibilidad de tres estructuras de la proteína ortóloga en Maccaca mulata en el PDB (6IF55GMF y 5GMH), que fueron usadas como punto de partida para hacer varias simulaciones de dinámica molecular que se describen con detalle (3 páginas) en el material suplementario,

hasta pronto,

Bruno

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