hoy me he encontrado el estupendo material de John Hickey sobre selección genómica y en general sobre mejora genómica tanto de animales como plantas. Lo ha hecho público en https://alphagenes.roslin.ed.ac.uk/wp/teaching-2
Sirva de muestra el índice de las charlas de su último curso:
- Plant and animal breeding - exploit new technologies in different ways and at different scales
- Compare and Contrast of Breeding programs
- Genomic data
- Phasing and imputation with heuristics
- Sequencing strategies and how to exploit it in breeding
- Optimal Cross Selection (Optimal contribution selection & Cross Allocation)
- Hidden Markov Models for Imputation
- AlphaSimR - A flexible package to simulate breeding programs
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| Definición de fases y haplotipos, tomada de https://alphagenes.roslin.ed.ac.uk/wp/wp-content/uploads/2019/05/04-JohnHickeyHeuristicsPhasingImputationKWSMarch2019.pdf |
Tienen además ejercicios en un paquete de R que se llama AlphaLearn.
Que lo disfrutéis,
Bruno
