Proteínas y dominios en la inmunidad de las plantas

Un tema recurrente en la literatura genómica de plantas son los genes de resistencia a enfermedades, que tienen valor agronómico y son sospechosos habituales en los estudios a escala pangenómica. Hemos hablado de ellos en este blog, por ejemplo aquí. 

Trabajos recientes, resumidos por JL Dangl y JDG Jones, sugieren que hay mecanismos de defensa mediados por derivados de nucleótidos (pRib-AMP y pRib-ADP) que convergen a una ruta común en especies mono y dicotiledóneas.

Fuente: https://doi.org/10.1126/science.adu4930

Estas son las proteínas y dominios que debes aprender a reconocer para entender estos mecanismos:

• Nucleotide-binding leucine-rich repeat (NLR o NB-LRR). Cuando contienen dominios N-terminales Toll/interleukin-1 receptor (TIR) forman parte de la clase de receptores de inmunidad innata de las dicotiledóneas (TNLs).
  
• Las monocotiledóneas no tienen TNLs. En cambio, tienen proteínas “TIR-only” proteins, ROD1 (Ca2+-binding C2 class) y EDS1, PAD4, y ADR1 (que perciben las moléculas señal). Tras la infección ROD1 es degradada por ubiquitina ligasas E1 (RIP1, APIP6).
  
• Nicotinamide adenine dinucleotide glycohydrolases (NADasas) con dominios TIR oligomerizan con TNLs y efectores de virulencia para producir moléculas señal basadas en nucleótidos.
  
• Lipase-like EDS1 (enhanced disease susceptibility 1). Forma heterodímeros con SAG101 (senescence-associated gene 101) or PAD4 (phytoalexin-deficient 4).
• NLR ayudantes ADR1 (activated disease resistance 1) o NRG1 (N required gene 1), reclutados por EDS1 para formar canales de calcio membranales que desencadenan muerte celular.