Word + bioinformática = CRISPR

Hola,
este será un artículo muy breve, porque tengo poco que escribir yo mismo, a parte de volver a comprobar una vez más que la ciencia básica, tan denostada a menudo, es a menudo fundamental para los avances más espectaculares de la ciencia aplicada.  En vez de contar yo aquí una historia hoy os invito a leer la increíble historia del descubrimiento de los sistemas CRISPR-Cas9, que ya están revolucionando la ciencia y pronto la medicina.

La fuente original, Cell, bajo subscripción:
http://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674%2815%2901705-5

Un resumen en español en El Confidencial:
http://www.elconfidencial.com/tecnologia/2016-01-16/crispr-francis-mojica-charpentier-doudna-edicion-genomica_1136337/

Reconocimiento de una hebra sencilla de DNA por hibridación de un RNA guía de 32 bases (crRNA) por parte del complejo de proteínas Cascade. Tomado de [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4427192/]. Como se ve en nuestro repositorio 3D-footprint, la especificidad de reconocimiento es de las más altas observadas entre proteínas naturales: http://floresta.eead.csic.es/3dfootprint/complexes/4qyz_ABCDEFGHIJ.html

 Ah, y por cierto, esta historia una cura de humildad para los que nos dedicamos a inventar y probar complicados algoritmos. A veces, la herramienta "Buscar y reemplazar" de Word es todo lo que hace falta para hacer descubrimientos en Biología, como a veces me recuerda mi colega Ana Casas, y eso también es Biología computacional,
un saludo,
Bruno

Bioinformática en C (y perl6 async)

Hola, y feliz año!
tras la última entrada, y antes de que escriba algo más completo sobre perl6,
parece que la gestión de tareas asíncronas tiene mucho potencial...

Pero vamos a lo que vamos. Hoy quería compartir un documento sobre cómo programar en C con los compiladores actuales, porque algunos todavía seguimos usando sintaxis anticuada y esto es relevante en nuestro campo, dado que hay muchas aplicaciones bioinformáticas escritas en C, normalmente por cuestiones de eficiencia.

El documento en cuestión es: https://matt.sh/howto-c

y ofrece un montón de trucos y recomendaciones para modernizar y simplificar la escritura de código en C, con ejemplos sencillos como éste para vectores dinámicos:

 uintmax_t arrayLength = strtoumax(argv[1], NULL, 10);
    void *array[arrayLength];

 /* Hace innecesario liberar el puntero al final.

    Ojo: debe ser un tamaño razonable para el sistema donde se ejecute. */

Ha sido traducido al español aquí y comentado/criticado aquí y en menéame,
un saludo,
Bruno