como anunciábamos hace unas semanas, esta semana participamos en un curso de verano de la Universidad de Zaragoza que empieza hoy en la ciudad de Jaca, al pie mismo del Pirineo. Por esta razón hemos preparado un material sobre Alineamiento de secuencias de proteína y filogenias que hoy colgamos en la Red para que podáis consultarlo si a alguien le interesa:
http://eead.csic.es/compbio/material/alineafilog
y que también podés descargar en formato PDF en:
http://digital.csic.es/handle/10261/117608
El índice del curso es el siguiente:
- Análisis jerárquico de la estructura de proteínas
- Estructura primaria
- Estructura secundaria
- Estructura terciaria y cuaternaria
- Demarcación de dominios en proteínas
- Comparación de secuencias de proteína y conservación de su estructura y función
- Algoritmos de alineamiento y matrices de sustitución de aminoácidos
- Alineamiento múltiple (normalmente global)
- Alineamiento pareado (normalmente local)
- Algoritmos de alineamiento y matrices de sustitución de aminoácidos
- Modelos evolutivos de proteínas
- Cómo evolucionan las secuencias de genes y proteínas
- Cómo se infiere una filogenia a partir de secuencias de proteínas
- Ejercicios
- Búsqueda de secuencias homólogas de una proteína problema
- Alineamiento múltiple de la familia de proteínas
- Determinación del modelo evolutivo mas verosímil
- Reconstrucción de una filogenia molecular
Un saludo,
hasta pronto,
Bruno
