Correlaciones y regresiones en R

Hola,
al analizar datos es frecuente que recurrir al cálculo de correlaciones, que permiten establecer si dos variables covarían, y de regresiones, que permiten modelar de qué manera conociendo una variable podemos estimar la otra. De hecho ya habíamos tocado este tema en este blog.

Hoy quisiera compartir el estupendo material sobre estas materias que ha preparado nuestro colega Pablo Vinuesa, que podéis explorar en línea y con ayuda de Rstudio, por ejemplo, para probar todo el código de los ejemplos:

• correlación: [http://www.ccg.unam.mx/~vinuesa/R4biosciences/docs/Tema8_correlacion_presentacionR.html#/]


• regresión: [http://www.ccg.unam.mx/~vinuesa/R4biosciences/docs/Tema9_regresion_presentacionR.html#/]

Un saludo,
Bruno

extraer TSV de todas las hojas de un libro excel

Hola,
cuando intercambiamos datos en al laboratorio a menudo usamos libros Excel, en formato XLSX, con varias hojas. Ahora bien, si luego queremos convertirlos a ficheros con valores separados por tabuladores (TSV) o comas (CSV), MS Excel sólo te permite hacerlo de hoja en hoja, lo cual es un poco latoso para libros gordos. Aquí os pongo un script en Perl para hacer esta tarea desde el terminal, que requiere instalar el módulo Spreadsheet::ParseXLSX, por ejemplo con:

$ sudo cpan -i Spreadsheet::ParseXLSX

El código es:

#!/usr/bin/perl -w
# get separate tab-separated (TSV) files from sheets in Excel .xlsx file 
use strict;
use Spreadsheet::ParseXLSX;

die "# usage: $0 <infile.xlsx> \n" if(!$ARGV[0]);

my $parser = Spreadsheet::ParseXLSX->new();
my $book = $parser->parse($ARGV[0]);
foreach my $sheet (@{$book->{Worksheet}})
{
  open(TSV,'>',"$sheet->{'Name'}.tsv") || 
    die "# cannot create $sheet->{'Name'}.tsv: $!\n";

  foreach my $row ($sheet->{'MinRow'} .. $sheet->{'MaxRow'})
  {
    foreach my $col ($sheet->{'MinCol'} ..  $sheet->{'MaxCol'})
    {
      print TSV "$sheet->{'Cells'}->[$row]->[$col]->{'Val'}\t";
    } print TSV "\n";
  }

  close(TSV);
}

Si guarmos el código en un fichero de nombre xlsx2multitab.pl, podemos invocarlo de la siguiente manera:

$ perl xlsx2multitab.pl libro.xlsx

En el directorio actual se guardará un fichero .tsv por cada hoja del libro,
hasta luego,
Bruno