25 de marzo de 2014

XII Jornadas de Bioinformática / XII Symposium on Bioinformatics

Hola,
hoy damos difusión a las pŕoximas Jornadas de Bioinformática, el mayor evento científico sobre biología computacional en España. Esta es la información que tengo de momento:


The XII Symposium on Bioinformatics (XII Jornadas de Bioinformática) will take place on 21-24 September in Sevilla, Spain, at cicCartuja (CSIC-US). 

The 21st will be the student symposium, and the main conference will start on Monday the 22nd. The URL for the meeting is: 


http://www.bioinformaticsconference2014.org/

(programme/committees are still preliminar, but will be updated periodically)
With the aim of encouraging the participation of younger bioinformaticians this year’s symposium main theme is “Bioinformatics: The New Breed”.Abstracts topics include but are not limited to:
  • Integrative Biology (NGS, -omics technologies...)
  • Structural Bioinformatics and function prediction
  • Algorithms, method, and tools development
  • Metagenomics
  • Medical Informatics 

    Abstract submission closes Thursday, July 31, 2014 

PD 25 de Agosto: nuestro laboratorio presentará dos charlas seleccionadas en las secciones de Metagenómica y Estructura y Función. Además Álvaro Sebastián, colaborador habitual del blog presentará un libro de texto sobre Bioinformática en español, en la sección The Unworkshop format.

20 de marzo de 2014

Copia de seguridad de todas nuestras bases de datos MySQL, usuarios y demás

Esta mañana me he puesto a migrar el servidor MySQL y quiero compartir un par de comandos que me han salvado horas de tiempo y muchos dolores de cabeza...

El primero permite hacer una copia de seguridad de todas nuestras bases de datos, incluso las internas de MySQL en un solo archivo:
  • mysqldump -u username -p -–all-databases > file.sql
No preocuparse si aparece el mensaje: "-- Warning: Skipping the data of table mysql.event."

Si queremos comprimir el archivo podemos ejecutar el comando anterior de la siguiente forma:
  • mysqldump -u username -p -–all-databases | gzip > file.sql.gz

Y para instalar en el nuevo servidor nuestras bases de datos y configuraciones (o para recuperar la copia de seguridad en nuestro ordenador) basta con ejecutar:
  • mysql -u username -p < file.sql

Finalmente deberemos reiniciar el servicio MySQL para recargar usuarios, permisos y demás:
  • sudo /etc/init.d/mysql restart

 Espero que estas simples indicaciones le salven la base de datos a más de uno.