7 de marzo de 2011

El Protein Data Bank en El País

Buenos días,
antes de seguir con las estructuras de datos, que dejamos para otro día, hoy me gustaría destacar que recientemente ha salido en el diario El País, uno de los más leídos en español, un artículo donde se resumían los últimos avances en las técnicas de resolución de estructuras moleculares, que poco a poco parece que se van encaminando al estudio de moléculas individuales. El artículo original, muy interesante,  es Destellos brillantes y ultracortos iluminarán la nueva biología estructural.
La verdad me sorprendió gratamente encontrarme en la prensa generalista con información reciente y relevante de acerca del Protein Data Bank (PDB), el recurso sobre el que se construye la Bioinformática Estructural, pero más me sorprendí al descubrir que en realidad el PDB había sido objeto de al menos otros 3 artículos en el mismo diario en años recientes, todos ellos firmados por Cele Abad Zapatero:
2004) La revolución de los rayos X
2007) ¿Morirá de éxito la biología estructural?
2010) Medio siglo de las primeras estructuras de proteínas

Si no habéis usado nunca el PDB, el enlace principal es http://www.rcsb.org,  y una entrada típica, como la 1le8, contiene imágenes como ésta:

Por supuesto podéis acceder a él desde vuestros programas Perl, por ejemplo con el módulo WWW::PDB. En el curso de Algoritmos en Bioinformática Estructural hay varios ejemplos de usos de archivos de coordenadas en formato PDB.

Un saludo y que vaya bien la semana,
Bruno

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