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9 de marzo de 2023

instalación de slurm en servidor multi-core Debian

Hola,

hace un tiempo explicaba aquí cómo montar grid-engine en Debian para gestionar trabajos paralelos en un servidor multicore. Como he tenido algunos problemas he probado slurm, que está activamente desarrollado y documentado. 

 GitHub - SupreethRao99/slurmy: template scripts and notes for using SLURM  on Nvidia DGX GPU cluster

En concreto lo he hecho sobre un servidor Debian 11. Si vienes de otros sistemas, como LSF, tendrás que convertir tus comandos con tablas como ésta. Los pasos que he seguido los he adaptado de aquí:

sudo apt install slurmd slurmctld -y
sudo chmod 777 /etc/slurm

# creo fichero de configuración /etc/slurm/slurm.conf,
# tendrás que adaptar CPUs= y RealMemory= al final ,
# en mi caso he definido "16 nodos"

sudo cat << EOF > /etc/slurm/slurm.conf
# See the slurm.conf man page for more information.
#
ClusterName=localcluster
SlurmctldHost=localhost
MpiDefault=none
ProctrackType=proctrack/linuxproc
ReturnToService=2
SlurmctldPidFile=/var/run/slurmctld.pid
SlurmctldPort=6817
SlurmdPidFile=/var/run/slurmd.pid
SlurmdPort=6818
SlurmdSpoolDir=/var/lib/slurm/slurmd
SlurmUser=slurm
StateSaveLocation=/var/lib/slurm/slurmctld
SwitchType=switch/none
TaskPlugin=task/none
#
# TIMERS
InactiveLimit=0
KillWait=30
MinJobAge=300
SlurmctldTimeout=120
SlurmdTimeout=300
Waittime=0
# SCHEDULING
SchedulerType=sched/backfill
SelectType=select/cons_tres
SelectTypeParameters=CR_Core
#
#AccountingStoragePort=
AccountingStorageType=accounting_storage/none
JobCompType=jobcomp/none
JobAcctGatherFrequency=30
JobAcctGatherType=jobacct_gather/none
SlurmctldDebug=info
SlurmctldLogFile=/var/log/slurm/slurmctld.log
SlurmdDebug=info
SlurmdLogFile=/var/log/slurm/slurmd.log
#
# COMPUTE NODES
NodeName=localhost CPUs=16 RealMemory=200 State=UNKNOWN
PartitionName=LocalQ Nodes=ALL Default=YES MaxTime=INFINITE State=UP
EOF

# iniciamos el gestor
sudo chmod 755 /etc/slurm
sudo systemctl start slurmctld
sudo systemctl start slurmd

# probamos el cluster
sinfo
sbatch --wrap=date
cat slurm-1.out 

PD Para ver las propiedades de tu nuevo "cluster" puedes probar:

scontrol show node

Hasta pronto, 

Bruno