Curso NGS en Zaragoza (30-31 Enero 2014)

Hola,
nuestro colega Miguel Pérez-Enciso impartirá los días 30-31 de Enero (30, mañana y tarde; 31, mañana) un curso básico de análisis de datos NGS en el Salón de actos de la facultad de veterinaria de la Universidad de Zaragoza, invitado y organizado por Luis Varona. El curso es gratuito y no requiere inscripción.

El horario será:
jueves   30: 11-14H y 16-18H
viernes  31: 10-13H


Si consigo un enlace con el material del curso lo pondré aquí, de momento no sé mucho más que lo que aparece en el propio material que Miguel usa (http://www.icrea.cat/Web/OtherSectionViewer.aspx?key=1403&titol=2012):

"This is a short introductory course for NGS analyses.
The course assumes no knowledge on NGS data or data analyses, rather to the contrary, if you have experience , you will be disappointed. It is not yet a hands-on course, I will rather present the material theoretically but I am open with help in the analyses. I assume you are a computer illiterate biologist but that you have realized that you need computers in daily life. You are willing to:

Analyze by yourself the data
Willing to learn linux and perl or similar (python ...)
The main topics covered are:
FASTQ format and sequence quality (Phred score and fastqc software)
A simple pipeline: BWA + Samtools
Visualization: IGV
Identifying SNPs: Samtools
Annotating SNPs: ensembl vep.pl
Identifying structural variants
RNAseq: tophat + cufflinks
Population genetics: pools and individuals
Association studies with sequence: IBSeq

All topics are treated at very beginners level and superficially (check accompanying slides)"

Feliz año a todos,
Bruno

BIFI 2012 - V Congreso Internacional - Dianas proteicas: Descubrimiento de Compuestos Bioactivos

Del 1 al 4 de febrero de 2012 se celebrará en Zaragoza la 5º Congreso Internacional del Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos (BIFI).

Este año el tema central será el Descubrimiento de Fármacos, cubriendo desde los pasos iniciales de investigación en laboratorio hasta los estudios preclínicos: nuevas dianas proteicas, validación de dianas, nuevas metodologías y herramientas de caracterización tanto estructural como funcional y cribado computacional de moléculas. La conferencia servirá de punto de encuentro de investigadores del campo del descubrimiento de fármacos, donde se discutirán los avances más recientes y retos futuros.

Nuestro laboratorio asistirá al evento con un seminario titulado "Protein-DNA interface prediction techniques: performance and potential in protein engineering" y un póster titulado: "In vivo DNA binding pattern of Rex-1 in mouse embryonic stem cells" realizado en colaboración con el Departamento de Veterinaria de la Universidad de Zaragoza.

English version:

The V International Conference of the Institute for Biocomputation and Physics of Complex Systems (BIFI) on February 1-4, 2012.

The meeting will be an international conference on Drug Discovery from a protein perspective, covering most of the initial steps in drug discovery and preclinical studies (new protein targets, protein target validation, new methodologies and tools for structural and functional characterization, experimental and computational high-throughput screening, etc.). We wish the conference to represent a venue for gathering active researchers on drug discovery, with strong roots in the scientific and academic communities to discuss recent developments and future challenges in the field.

Our laboratory will participate in the event with a talk titled "Protein-DNA interface prediction techniques: performance and potential in protein engineering" and a poster titled: "In vivo DNA binding pattern of Rex-1 in mouse embryonic stem cells" in collaboration with the Veterinary Department of the University of Zaragoza.