Hola,
tras un parón de casi 4 años acabo de actualizar el curso de Algoritmos en Bioinformática Estructural que llevaba manteniendo desde 2008 para mis antiguos alumnos de la Licenciatura en Ciencias Genómicas de la UNAM en Cuernavaca.
Puedes encontrar la v2022 en:
http://eead-csic-compbio.github.io/bioinformatica_estructural
Figura. Comparación de predicciones de AlphaFold2 y OpenFold para la estructura 7KDX:B. Figura tomada de https://github.com/aqlaboratory/openfold.
Principales novedades:
- Código fuente en el repositorio https://github.com/eead-csic-compbio/bioinformatica_estructural; puedes proponer cambios y correciones.
- Formateado con el paquete de R Bookdown en Rstudio; ahora es más fácil de leer en cualquier pantalla.
- Se retiraron algunas URLs .
- Nuevas referencias añadidas con TexMed .
- Actualizada la sección "El Protein Data Bank y sus formatos".
- Añado Foldseek en seccion "Comparación de estructura terciaria entre proteínas".
- Nuevo capítulo "AlphaFold y la revolución del aprendizaje automático" ordenando y completando lo que de este tema hemos ido compartiendo en este blog.
Hasta pronto,
Bruno
