Actualización de Algoritmos3D

Hola,
sirva esta entrada para publicar la versión actualizada del material sobre "Algoritmos en Bioinformática estructural", que podéis encontrar en:

http://eead-csic-compbio.github.io/bioinformatica_estructural

Este material lo usamos anualmente en la licenciatura en ciencias genómicas de la UNAM en el campus de Cuernavaca, México.

Predicción de estructuras protéicas a partir de sus patrones de mutaciones correlacionadas en secuencias homólogas, tomada de http://science.sciencemag.org/content/355/6322/248.full. Ests tipo de protocolos se presentan en la sección http://eead-csic-compbio.github.io/bioinformatica_estructural/node35.html.

Un saludo,
Bruno

Congreso BIFI2014 y taller internacional de bioinformática

Hola,

la próxima semana el laboratorio estará en dos eventos simultáneos:

http://bifi.es/events/bifi2014

http://congresos.nnb.unam.mx/TIB2014

1) los Talleres Internacionales de Bioinformática TIB2014, donde Carlos Pérez Cantalapiedra participa como profesor en el "Taller 2: Bioinformática para análisis de datos de secuenciación masiva (NGS)". Este evento tiene lugar en el campus UNAM en Cuernavaca, Morelos, México. Aprovecho para señalar que, entre otras muchas herramientas y utilidades para el manejo de datos NGS, Carlos empleará dos programas desarrollados en el laboratorio, uno escrito en C++ y otro en Perl:

•  split_pairs: efficient kseq-based program to sort and find paired reads within FASTQ/FASTA files, with the ability to edit headers with the power of Perl-style regular expressions
•  split_blast: Perl script to take advantage of multi-core CPUs for doing BLAST searches that fit in RAM, del que ya hablamos en este blog

2) la IV International Conference BIFI 2014, en Zaragoza, España, donde el laboratorio presenta varios pósters y una charla sobre trabajo reciente.

Nos vemos allí, un saludo,

Bruno