Hola, ayer escuché por videoconferencia un rato de la última charla que dio Janet Thornton en el EMBL-European Bioinformatics Institute antes de jubilarse.
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| fuente: EMBL |
Janet ha sido sin duda una de las madres de la bioinformática, sobre todo en el área de la bioinformática estructural. Por ejemplo, tiene su propio modelo de sustitución de aminoácidos para hacer filogenias (JTT). Podéis ver su enorme influencia en la literatura en EuropePMC, o las palabras que le dedican Alfonso Valencia o Roland Dunbrack. Entre la larga lista de discípulos están por ejemplo David Jones (la J del modelo JTT, parte del equipo de AlphaFold y examinador de mi tesis), Christine Orengo o Nick Luscombe, todos ellos autores a los que he citado innumerables veces.
Yo la conocí personalmente en un congreso en Brasil, el ISMB2006, donde tuve la fortuna de tener una reunión cara a cara con ella donde me dio consejos y ánimos para mi incipiente carrera en la ciencia. Hace 4 años volvimos a coincidir en la cafetería del EMBL-EBI y recordando ese rato me dijo algo como "no te ha ido tan mal, verdad?".
En su charla recordaba observaciones que ella y su grupo habían hecho en las últimas décadas sobre la lista de aminoácidos importantes para explicar la catálisis de las enzimas. Eso le dio pie a repasar los resultados de los últimos años de trabajo, liderados por Antonio Ribeiro, donde se han centrado en sistematizar las reglas y en medir de manera objetiva la similitud entre mecanismos enzimáticos, ganando capacidad predictiva por el camino (ver por ejemplo https://europepmc.org/article/MED/36659981 y https://europepmc.org/article/PPR/PPR540240). Terminó esta parte de la charla, la última que pude seguir, diciendo que lo más difícil de jubilarse era no poder planear nuevos experimentos y estudios para todo lo que queda por saber. Creo que esa curiosidad es el motor para muchos de nosotros, no tengo nada más que añadir,
hasta pronto,
Bruno
