#!/perl/bioinfo

Hola, para empezar el año la gente genómica a menudo se cita en una de las conferencias más importantes del año, PAG . Allí se juntan los...

Hola, en entradas pasadas, como ésta de 2010, ya hemos hablado de cómo ordenar resultados tabulares de BLAST con GNU sort . Entre tanto so...

Hola, espero que estéis bien. En esta primera entrada del año solamente quería señalar que BLAST+ fue actualizado a la versión 2.8.1+ hace...

Hi, today I wanted to let you know about a tool that we discovered recently that has been very useful for us. Its name is SequenceServer ( ...

El alineamiento de secuencias repetitivas o regiones de baja complejidad en la version ncbi-blast-2.2.27+ muestra diferentes "Best h...

Hola, hace unas semanas descubrí gracias a mi colega Pablo Vinuesa que BLAST+ del NCBI iba ya por la versión 2.6.0 . Cuando miré el resumen...

Hi, in a recent post I discussed the performance of DIAMOND when aligning nucleotide sequences against a peptide database. However, as th...

Hola, hoy quería hablar de herramientas de búsqueda de secuencias de proteína, uno de los caballos de batalla en nuestro trabajo. Es un tem...

Hola, esta semana hemos participado en un taller de 6 días organizado por Mirko Rossi (Universidad de Helsinki, Finlandia) donde hemos r...

Hola, en esta entrada quisiera mostraros una manera de buscar secuencias de proteínas dentro de la base de datos estrictamente no redundant...

BLAST cambió hace ya algún tiempo a mejor con su versión BLAST+ pero por el camino se olvidó de algún detalle que puede confundir a más d...

Hola, en el último número de Applied and Environmental Microbiology mi colega Pablo Vinuesa y yo publicamos un artículo describiendo el...

El otro día Bruno publicó en una entrada del blog un script en Perl para optimizar el tiempo de cálculo de Blast en ordenadores con proce...

Hola, sin duda BLAST es una de las herramientas esenciales para cualquiera que se dedique a la bioinformática. En una entrada anterior ya c...

Hola, hace tiempo que tenía pendiente escribir sobre una de las ramas más recientes de la familia de programas BLAST, que se llama deltabla...

Hola y feliz año nuevo con retraso! Recientemente me he visto en la necesidad de acceder de maneara aleatoria a secuencias de un archivo FA...