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Ideas y código para problemas de genómica de plantas, biología computacional y estructural
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26 de septiembre de 2022
Probamos miniprot para mapear proteínas sobre genomas
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Hola, hoy escribo a mi regreso del X Congreso Nacional de Mejora Genética de Plantas , donde se habló y mucho de herramientas de genómica c...
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12 de septiembre de 2020
Alineamiento global con el algoritmo Wavefront (WFA)
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Hola, en esta entrada vuelvo a una de las piedras angulares de la biología computacional, el alineamiento de secuencias. Este problema tiene...
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25 de abril de 2017
rendimiento multihebra de BLAST+ 2.6.0
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Hola, hace unas semanas descubrí gracias a mi colega Pablo Vinuesa que BLAST+ del NCBI iba ya por la versión 2.6.0 . Cuando miré el resumen...
19 de julio de 2010
Alineamiento perfil-perfil teniendo en cuenta la estructura secundaria
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Con el alineamiento múltiple de secuencias de proteínas relacionadas se puede construir un perfil. A parte de su uso en técnicas de fold rec...
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