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Ideas y código para problemas de genómica de plantas, biología computacional y estructural
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11 de febrero de 2014
Jugando a leer y extraer secuencias de un fichero FASTQ comprimido con GZIP (.fq.gz)
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Un fichero con extensión '.fq.gz' es un fichero en formato FASTQ comprimido en formato GZIP . Los ficheros FASTQ con datos de los ...
21 de noviembre de 2012
Comprimiendo BLAST
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Hola, ya hemos hablado antes en este blog de las crecientes aplicaciones de los algoritmos de compresión en la bioinformática. Hoy precisa...
9 de septiembre de 2011
Leyendo archivos comprimidos .gz
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Hola, tras la entrada ' Compresión de secuencias de ADN ', que ya utilizaba el módulo estándar Compress::Zlib , en este ejemplo se ...
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9 de diciembre de 2010
Compresión de secuencias de ADN
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Un problema que me ha surgido recientemente es el de manejar en memoria RAM grandes volúmenes de secuencias de ADN, en mi caso genes, pero ...
1 comentario:
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