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Hola, hoy cuento cómo cortar subsecuencias de un genoma correspondientes a elementos anotados en un fichero GFF asociado, que tienen este a...

Un fichero con extensión '.fq.gz' es un fichero en formato FASTQ comprimido en formato GZIP . Los ficheros FASTQ con datos de los ...

Buenas, recientemente en el laboratorio hemos estado manipulando archivos de pares de secuencias ( pair-end reads ) en formato FASTQ . Una...

Hola, hoy quería compartir recetas en Perl para la comparación eficiente de secuencias de igual longitud. Las dos funciones que vamos a ve...

En 1992 el grupo de Ilya Vakser publicó en PNAS el método fundamental para poder hacer simulaciones de docking de biomoléculas de manera ...

Hola, ayer me encontré en la Red una revisión, publicada en Mayo de 2011 por TC Glenn , que contiene la siguiente tabla, muy útil  para com...

Dada una secuencia de proteína, puede interesarnos bajar de una sola vez todas las secuencias de proteínas ortólogas conocidas. Si aceptamos...

Hola, en el 11 GABI Status Meeting, que tuvo lugar recientemente en Alemania, nos anunciaron el siguiente taller de verano, que tendrá lug...

Un problema que me ha surgido recientemente es el de manejar en memoria RAM grandes volúmenes de secuencias de ADN, en mi caso genes, pero ...

Como complemento a la entrada anterior de Álvaro os paso un enlace al programa CD-HIT , que es una opción muy cómoda y eficiente para elim...

Una situación cada vez más habitual en genómica y proteómica es la redundancia de datos. Con las modernas técnicas de secuenciación de alto ...