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Ideas y código para problemas de genómica de plantas, biología computacional y estructural

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26 de septiembre de 2022

Probamos miniprot para mapear proteínas sobre genomas

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Hola,  hoy escribo a mi regreso del X Congreso Nacional de Mejora Genética de Plantas , donde se habló y mucho de herramientas de genómica c...
5 comentarios:
15 de septiembre de 2021

Cortar secuencias desde un fichero GFF y un FASTA del genoma

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Hola, hoy cuento cómo cortar subsecuencias de un genoma correspondientes a elementos anotados en un fichero GFF asociado, que tienen este a...
3 comentarios:
19 de febrero de 2021

mapeando genes con liftoff

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Hola, esta semana en Ensembl tuvimos que probar a mapear genes de un ensamblaje genómico de arroz sobre otro ensamblaje más reciente. Esto s...
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