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Ideas y código para problemas de genómica de plantas, biología computacional y estructural

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21 de abril de 2021

Dos versiones del mismo genoma: el caso de la cebada

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Hola, una de las plantas con las que hemos trabajado más en los últimos años es la cebada ( Hordeum vulgare ), un cultivo de enorme importa...
24 de marzo de 2017

Apuntes sobre ensamblaje de genomas de plantas

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Buenas, ayer asistimos Ernesto Igartua y yo al 6th CNAG Symposium on Genome Research: Agrigenomics , organizado por el Centro Nacional de A...
2 comentarios:
2 de agosto de 2016

One-liner para calcular el N50 de un ensamblaje

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Hola, el estadístico N50 se usa a menudo para resumir a grosso modo un ensamblaje de secuencias, que generalmente es un fichero FASTA con u...
10 de octubre de 2014

Apuntes de genómica microbiana

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Hola, esta semana hemos participado en un taller de 6 días organizado por Mirko Rossi (Universidad de Helsinki, Finlandia) donde hemos r...
15 de noviembre de 2011

grafos de De Bruijn

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Hola, un artículo educativo publicado recientemente en Nature Biotechnology me ha vuelto a recordar los grafos de De Bruijn, que ya había...
1 comentario:
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