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Ideas y código para problemas de genómica de plantas, biología computacional y estructural

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11 de febrero de 2021

eliminar redundancia en grandes ficheros de nucleótidos (linclust)

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Hola, recientemente me vi en la necesidad de eliminar redundancia de un fichero con millones de secuencias de nucleótidos. En mi caso se tra...
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17 de mayo de 2019

agrupando secuencias de proteínas con Linclust

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Hola, de vez en cuando tengo que revisar un viejo script para actualizar mi copia local del Protein Data Bank (PDB). El programa descarga ...
17 de junio de 2016

pseudoalineamientos y conteos de tránscritos

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Hola, durante el análisis de unos experimentos de RNAseq mi colega Carlos Cantalapiedra y yo nos desesperábamos al calcular los valores d...
2 comentarios:
14 de abril de 2015

HOWTO install Grid Engine on multi-core Linux box to run GET_HOMOLOGUES

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Hi, I post this in English so that all users of GET_HOMOLOGUES can benefit. It is inspired on a previous tutorial posted in scidom and the...
2 comentarios:
20 de junio de 2011

Creando un cluster Rocks virtual

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Hola, mientras actualizaba el material didáctico de Programación en clusters Rocks a la versión actual de Linux Rocks (5.4) me pareció bu...
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