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Ideas y código para problemas de genómica de plantas, biología computacional y estructural
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2 de junio de 2022
Traducir codones a aminoácidos en el terminal
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Hola, hoy me he vuelto a encontrar con una tarea frecuente cuando trabajas con secuencias genómicas, la de traducir codones a aminoácidos. P...
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4 de julio de 2017
rooting and laddering Newick trees
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Buenas, esta entrada es para compartir un script Perl para enraizar árboles, muchos árboles, de manera automática, y ordenar los nodos por...
3 de noviembre de 2015
Anotando datos del NCBI de forma automática con un script de Perl
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Esta semana me di cuenta que un antiguo script de Perl que leía datos bibliográficos de Pubmed automáticamente había dejado de funcionar. ...
11 de enero de 2013
Indexando archivos FASTA
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Hola y feliz año nuevo con retraso! Recientemente me he visto en la necesidad de acceder de maneara aleatoria a secuencias de un archivo FA...
1 de junio de 2010
Extraer secuencias intergénicas de archivos GenBank
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La tarea de hoy consiste en leer un archivo GenBank, por ejemplo de un genoma circular bacteriano, con el fin de extraer las secuencias inte...
9 comentarios:
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