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Ideas y código para problemas de genómica de plantas, biología computacional y estructural

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23 de febrero de 2024

lectura eficiente de ficheros comprimidos en el terminal

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Al analizar datos genómicos a menudo tenemos que manejar ficheros de texto enormes, del orden de decenas de GB, que suelen estar comprimidos...
9 de enero de 2015

Algunos comandos útiles de linux para manejar ficheros FASTQ de NGS

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Leyendo la entrada de Bruno sobre la librería kseq.h me entraron ganas de recopilar en el blog unos valiosos comandos de Linux que nos pu...
1 comentario:
11 de febrero de 2014

Jugando a leer y extraer secuencias de un fichero FASTQ comprimido con GZIP (.fq.gz)

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Un fichero con extensión '.fq.gz' es un fichero en formato FASTQ comprimido en formato GZIP . Los ficheros FASTQ con datos de los ...
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