Hola,
hace unos meses contaba aquí el algoritmo
AlphaFold para plegar proteínas por predicción de distancias entre residuos, que había escuchado de boca de uno de sus creadores. Hoy me he encontrado con la evaluación oficial de
estructura terciaria del experimento
CASP13, donde AlphaFold se destacó como mejor grupo predictor. La conclusión se resume en esta figura:
Parece seguro decir que en CASP13 ha habido un salto en la calidad de las predicciones respecto a ediciones previas, a pesar de que la dificultad en esta edición es comparable a la anterior (Tabla 1 del artículo de
Abriata et al de la figura). Los evaluadores achacanla mejoría precisamente a que más allá de
predecir contactos, algunos de los mejores predictores, como A7D (AlphaFold),
MULTICOM o
RaptorX han empezado a predecir directamente distancias entre residuos, algo para la cual hacen falta alineamientos múltiples de secuencia muy profundos. Hasta luego,
Bruno
https://www.pnas.org/content/pnas/116/34/16856.full.pdf
ResponderEliminarThank you for sharing this.
ResponderEliminarTECHNOLOGIST
SCIENCE AND TECHNOLOGY IN INDIA
Some of Indian Technologist
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/prot.25800
ResponderEliminarhttps://academic.oup.com/bioinformatics/article/35/22/4862/5497249
ResponderEliminar