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Ideas y código para problemas de genómica de plantas, biología computacional y estructural

19 de febrero de 2021

mapeando genes con liftoff

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Hola, esta semana en Ensembl tuvimos que probar a mapear genes de un ensamblaje genómico de arroz sobre otro ensamblaje más reciente. Esto s...
11 de febrero de 2021

eliminar redundancia en grandes ficheros de nucleótidos (linclust)

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Hola, recientemente me vi en la necesidad de eliminar redundancia de un fichero con millones de secuencias de nucleótidos. En mi caso se tra...
3 comentarios:
3 de febrero de 2021

Consultas GraphQL al Protein Data Bank

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Hola,  durante el mantenimiento anual de footprintDB he descubierto que el Protein Data Bank ha cerrado su interfaz de web servicios (WS) h...
1 comentario:
19 de enero de 2021

Recursos en línea sobre el lenguaje Perl

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Hola,   la bioinformática se escribe en muchos lenguajes de programación. Aunque seguramente es ahora más minoritario, por el empuje de leng...
1 comentario:
14 de enero de 2021

Introduction to Bioinformatics for plant breeders

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Hi, Najla Ksouri and me recently put together teaching material about Bioinformatics resources and best-practices for plant-breeders. The m...
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