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Ideas y código para problemas de genómica de plantas, biología computacional y estructural
28 de agosto de 2017
mean sequence length in FASTA
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Hola, para calcular la longitud promedio de las secuencias de un fichero FASTA estábamos usando el siguiente comando de Perl en el terminal...
1 comentario:
9 de agosto de 2017
semillas con licencia Open Source
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Hola, los que programamos en entornos académicos llevamos muchos años usando software distribuido con licencias de tipo Open Source (OS)....
28 de julio de 2017
Tabla de estabilidad de sustituciones de aminoácidos
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Hola, a menudo nos preguntamos qué efecto puede tener un cambio de aminoácido sobre la estabilidad de una proteína. Una pregunta relacionad...
4 de julio de 2017
rooting and laddering Newick trees
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Buenas, esta entrada es para compartir un script Perl para enraizar árboles, muchos árboles, de manera automática, y ordenar los nodos por...
21 de junio de 2017
Leyendo FASTQ con CPAN
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Buenas, hace un par de años describía en otra entrada cómo leer de manera eficiente ficheros FASTQ con ayuda de kseq.h . Para ello definí ...
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