últimas ofertas de trabajo [15 / 05 / 2017]

[15/05/2017]

Sistemas Genómicos (Valencia, España)


Pues eso, podéis escribir a rrhh@sistemasgenomicos.com o en https://www.sistemasgenomicos.com/web_sg/web/contacto-cv.php


[11/05/2017]

Investigadores Junior y Senior en la Unidad de Investigación Traslacional de Navarrabiomed

We are seeking a highly motivated experienced bioinformatician to join the Translational Bioinformatics Unit in Navarrabiomed. The selected candidate will participate in research efforts on: multi-omic data-integration, workflow development and development of translational bioinformatics tools (such as patient stratification).

http://www.navarrabiomed.es/es/sobre-nosotros/proceso-de-seleccion?field_tipo_de_plaza_tid=All


[20 / 04 / 2017]

Investigador/técnico para el Programa de Biología Estructural y Biocomputacíon del CNIO (http://www.cnio.es/es/grupos/programa.asp?programa=50004289)
TIPO DE CONTRATO: 4 años, prorrogables cada año, asociado al proyecto GENCODE (https://www.gencodegenes.org)
SALARIO: Según experiencia
DEDICACIÓN: Tiempo completo
DESCRIPCIÓN DE ACTIVIDADES: Biología computacional, bioinformática: administración de sistemas y bases de datos; análisis relacionados con la anotación de la genoma humana, splicing alternativo y proteómica.
REQUISITOS DE LOS CANDIDATOS: Experiencia en biología computacional: programación en Perl, Javascript, entornos Unix/Linux, conocimiento de CSS, MySql y RCS
PROCEDIMIENTO: Enviar el CV a Michael Tress (mtress@cnio.es) cuanto antes.


Technician/researcher for the Structural Biology and Biocomputing Programme at the Spanish National Cancer Research Centre (CNIO) 
Type of contract: 4 years, renewable every year, associated to the GENCODE consortium project (https://www.gencodegenes.org)
Salary: According to experience
Dedication: Full time
Description of activities: Computational biology/bioinformatics in general. Specifically systems administration/databases along with analyses of data related to the annotation of the human genome, alternative splicing and proteomics.
Requirements: Experience in the general area of computational biology: in particular Perl, Javascript, Unix/Linux, CSS, MySql y RCS
Send curriculum to Michael Tress (mtress@cnio.es) as soon as possible.


[10 / 11 / 2016]

Contrato de Bioinformático en Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino

Lugar: Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino, Logroño,España
Duración: 12 meses, prorrogable, contrato de Titulado superior
Perfil de los candidatos:
  •  Titulación en bioinformática, biología, informática, u otras disciplinas relevantes.  Máster en bioinformática. 
  • Formación en Linux, Shell Scripting y programación en Perl y R. 
  • Experiencia en procesamiento de datos de RNA-seq y re-secuenciación de DNA: alineamiento, detección de variantes, herramientas de expresión diferencial. 
  • Se valorará la experiencia en el análisis de variación estructural a partir de datos de re-secuenciación de DNA y la capacidad de trabajo en equipo.
Más información: Las personas interesadas deben enviar una carta de interés y un CV al correo electrónico: zapater@icvv.es antes del 15 de diciembre de 2016.
El grupo de genética y genómica de la vid que dirige José M. Martínez Zapater, utiliza estrategias genómicas para investigar el origen de la variación somática en la vid y su aplicación en la mejora de las variedades de vinificación. En la actualidad el grupo centra su investigación en el estudio de la frecuencia y causas de esta variación así como de la diversidad genética generada en caracteres de calidad del fruto como el tamaño, forma o color. En el contexto de un proyecto financiado por el Plan Estatal \u201cRetos de la Sociedad\u201d, disponemos de un contrato para un bioinformático que colabore en el estudio de las causas de la variación somática para el color en variedades tintas. Los objetivos concretos son la comparación de genomas de variantes somáticas de Tempranillo y Garnacha con el fin de identificar las reorganizaciones cromosómicas que dan lugar a la pérdida de color y el análisis de datos de RNA-seq para valorar los cambios producidos a nivel de regulación de la expresión génica. La persona contratada se integrará en el equipo de investigación para desarrollar y mejorar los procedimientos de análisis, visualización y almacenamiento de secuencias genómicas y de RNA. En particular, su trabajo implicará también la búsqueda del origen de las reorganizaciones cromosómicas para investigar los mecanismos genéticos responsables y los procesos de mutación que generan esta variación somática en la vid.

Fernandez, L., Torregrosa, L., Segura, V., Bouquet, A., Martínez Zapater, J.M. 2010. Transposon induced gene activation as a mechanism generating cluster shape somatic variation in grapevine. Plant J. 61:545-557.


Fernandez, L., Chaib, J., Martinez-Zapater, J.M., Thomas, M.R., Torregrosa, L. 2013. Misexpression of a PISTILLATA-like MADS-box gene prevents fruit development in grapevine. Plant J. 73: 918-928.


Royo, C., P. Carbonell-Bejerano, R. Torres-Pérez, A. Nebish, O. Martínez, M. Rey, R. Aroutiounian, J. Ibáñez, J.M. Martínez-Zapater. 2016. Developmental, transcriptome and genetic alterations associated to parthenocarpy in the grapevine seedless somatic variant Corinto Bianco. J. Exp. Bot. 67: 259-273.


Royo, C., R. Torres-Pérez, J. Grimplet, L. Fernandez, J. M. Franco-Zorrilla, D. Lijavetzky, E. Baroja, J. Martínez, E. García-Escudero, J. Ibáñez, P. Carbonell-Bejerano and J. M. Martínez- Zapater. 2016. Genome-wide structural variation analyses unveil complex somatic chromosome rearrangements in the origin of grapevine white berry variants. (in preparation)

[30 / 09 / 2016]

Especialista bioinformático

Navarra Biomed (http://www.navarrabiomed.es/es) precisa contratar un especialista bioinformático con experiencia para la puesta en marcha de un servicio de apoyo a un proyecto de medicina genómica.
Detalles: http://www.navarrabiomed.es/es/sobre-nosotros/proceso-de-seleccion/16-18-bioinform%C3%A1tico

Plazo solicitud: hasta el 6 de octubre de 2016.


[23 / 03 / 2016]

Oferta beca JAE-INTRO 2016

Destinatarios: Alumnos matriculados en un Máster Universitario oficial en el curso 2015-2016 o preinscritos para el curso 2016-2017. Nota media del grado o la licenciatura igual o superior a 8,0.
Duración: 2 meses consecutivos, sept-oct 2016 / oct-nov 2016
Cuantía de la beca: 2.000€

Tema: ANÁLISIS DE LA INTERACCIÓN PROTEÍNA-LIGANDO DE INHIBIDORES
SELECTIVOS DE LA ENZIMA FERREDOXINA-NADP(H) REDUCTASA DE
XANTHOMONAS AXONOPODIS PV. CITRI (ref.: JAEINT16_EX_0325)

Descripción: El estudiante se introducirá en la investigación en el campo de la
Biología Estructural y Computacional, y se familiarizará con el manejo de
herramientas computacionales y bioquímicas para la identificación de
modificaciones en el sitio activo de la enzima XacFPR causadas por inhibidores
selectivos de las mismas con potencial biotecnológico. Estos estudios se enmarcan en una disciplina científica muy activa actualmente.

Contacto:  
Inmaculada Yruela Guerrero (EEAD-CSIC), i.yruela@csic.es
Milagros Medina Trullenque (Universidad Zaragoza), mmedina@unizar.es

Plazo solicitud: 11 de abril al 2 de mayo 2016.

Documentación: https://sede.csic.gob.es/intro2016



[16 / 02 / 2016]

Cátedras AXA-CSIC

AXA destina hasta 8 millones de euros cada año para apoyar la creación de 4-8 cátedras y de esta manera inducir cambios significativos en el desarrollo de una línea de investigación dentro un centro del CSIC. Su objetivo es  crear  una  posición  académica  a  tiempo  completo  en  el  centro receptor e impulsar la  carrera  de un investigador de prestigio. La duración de la cátedra AXA dependerá del centro y puede variar entre 5 y 30 años.

Aquellos investigadores interesados en postularse, tendrán que haber defendido su tesis doctoral hace más de diez años. Se espera  que el titular de la cátedra sea un científico de gran prestigio, de acuerdo con los indicadores de excelencia académica habituales (publicaciones el revistas internacionales de primera línea, colaboraciones,…). Además se valorará el carácter innovador del programa de investigación y la transformación que supondría la catedra AXA para el centro de acogida y la carrera científica del investigador.

La documentación requerida para presentarse a esta convocatoria, deberá  enviarse antes del día 18 de marzo de 2016 a la dirección de correo electrónico <axaconvocatoria@csic.es>. Los candidatos serán evaluados por un comité de expertos elegido por la Vicepresidencia  Adjunta de Internacionalización, siguiendo los criterios establecidos en la convocatoria de la Fundación AXA. Una vez seleccionado el mejor candidato, se remitirá su nombre y correo  electrónico a la Fundación AXA.





Información más detallada en:

https://www.axa-research.org/chairs

https://www.axa-research.org/sites/dev/files/A-Howtoobtain-Modus/Modus_Operandi_Chairs_2016_FINAL.pdf

 [27 / 11 / 2015]

Técnico en Bioinformática en la EEAD-CSIC 

(Zaragoza, Código: CM_ARA_EEAD_002 , Categoría: TSGSC)

El laboratorio de Biología Computacional y Estructural [www.eead.csic.es/compbio] de la Estación Experimental de Aula Dei, centro del Consejo Superior de Investigaciones Científica en Zaragoza, ofrece un contrato de dos años del Sistema Nacional de Garantía Juvenil. El salario es de 14x 1909EUR.

ACTIVIDADES A REALIZAR

1.    Administración de servidores Linux, mantenimiento de hardware y gestión de aplicaciones web del grupo, como [barleymap], [RSAT::plants] o [footprintDB].

2.    Trabajos del servicio de Bioinformática de la EEAD-CSIC.

3.    Diseño e implementación de un sistema de gestión, anotación y visualización de datos genómicos y agronómicos de cebada. El departamento  genera volúmenes importantes de secuencias genómicas y necesitamos una plataforma para ponerlos a disposición de la comunidad en combinación con la [colección nuclear de cebadas].



REQUISITOS

4.    Grado en Ingeniería Informática o título de Ingeniero en Informática.

5.    Resolución positiva de inscripción en el Fichero del Sistema Nacional de Garantía Juvenil. Lista completa de requisitos en: [empleo.gob.es/es/garantiajuvenil/darsealta.html]

6.    Entusiasmo por aprender biología y genómica, conocimientos de sistemas Linux y de algún lenguaje de programación.

7.    El plazo de presentación de solicitudes comprende del 27 de noviembre al 15 de diciembre.


Más información en [sede.csic.gob.es/garantia-juvenil-mineco] y por correo en la dirección bcontreras at eead.csic.es.




[29 / 09 / 2015]

Postdoc/profesor asociado en bioinformática en Langebio (Irapuato,México)

El grupo de Cei Abreu (http://ceiabreulab.org), integrante del Langebio (http://www.langebio.cinvestav.mx) ofrece un contrato con las siguientes características:

- Es una plaza de Profesor Visitante del Cinvestav. Esto en realidad es equivalente a una plaza de profesor/investigador normal, con la restricción de que solo puede durar 2 años. Si el candidato es bueno, y lo desea, tengo recursos como para continuar pagándole 1 año extra por proyecto.

- La plaza tiene prestaciones (aguinaldo, prima vacacional, seguro médico de gastos mayores, etc) y un salario que se determina a la hora de evaluar el CV en un proceso de puntitos bastante abierta. Típicamente alguien que ya tiene el título de doctor y unos pocos papers termina como con MXN$35,000 mensuales ya libres (la renta de una casa en Irapuato anda como en $5-$10k).

- Me interesa alguien que le entre con ganas a mis proyectos, pero que también pueda continuar o iniciar los suyos. Me gusta todo lo relativo a la regulación de la expresión y su evolución. Genes no-codificantes son mis favoritos. Pero tengo colaboraciones de todo un poco: metagenómica, transcriptómica en animales y plantas, interacciones durante simbiosis (con énfasis a explorar componentes de RNA participando en dicha interacción).

- Como referencia pueden consultar algunos de los papers en los que he participado (aunque hay varios proyectos en curso que no están representados todavía con publicaciones):

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=abreu-goodger+c[au]
https://scholar.google.ca/citations?user=tAeWw8AAAAAJ&hl=en

Requisitos:

- Requiero alguien que sí sepa programar y trabajar en ambientes tipo Linux. Soy flexible en cuanto a lenguajes y eso, pero aquí usamos R, Perl, Python, mas o menos en ese orden. Idealmente tendrán experiencia trabajando con datos de secuenciación masiva. Buen nivel de inglés es importante.

- A los candidatos les pido lo siguiente para ser tomados en cuenta: una carta de presentacion describiendo su experiencia e intereses y CV completo. [http://www.langebio.cinvestav.mx/?pag=304]


[26 / 06 / 2015]

PhD Quantitative studies on the epigenetic phenomena in the brain – bioinformatics and image analysis

The improvement and decreasing cost of next generation sequencing-based technologies provide the ideal conditions for the establishment of a first draft of long-range interactions in brain  chromatin, while recent technical advances in microscopy allow a better visualization of chromatin structure and organization in individual cells in three dimensions. We aim to combine the molecular and structural information obtained through these techniques to gain unprecedented insight into the changes of higher-order chromatin architecture driven by neuronal activity and their relationship with neuronal plasticity and gene expression. The project will be conducted between two labs: 

Dr. Angel Barco’s lab at the Instituto de Neurociencias UMH-CSIC (Alicante, SPAIN) and 
Dr. Grzegorz M. Wilczynski’s lab at the Nencki Institute of Experimental Biology (Warsaw, POLAND).

Barco’s lab: http://in.umh.es/barcolab/default.html
Wilczynski’s lab: http://en.nencki.gov.pl/laboratory-of-molecular-and-systemic-neuromorphology
 

Requirements: We are looking for an outstanding young researcher with a Msc degree in Bioinformatics; students at the stage of finalizing their Msc theses can also apply. Candidates with extensive experience in NGS data analysis and computer programming languages (e.g., R or Python) are especially welcome to apply. Applicants must provide:

• Expression of interest
• Description of research accomplishments and technical expertise
• Full CV, including detailed information about the academic qualifications
• 2-3 references
 

Salary: 2600 Euro/month, starting on October 1st, for 4 years

A postdoctoral positions may soon become available: Epigenomic profiling in the adult brain – bioinformatics analysis. Requirements: Outstanding researcher with a Msc degree in Bioinformatics and previous experience in the analysis of NGS data (publications); knowledge of computer programming languages (e.g., R or Python). Applicants must provide the same documents stated above.


Contact:
Dr Angel Barco (abarco@umh.es), Instituto de Neurociencias de Alicante, UMH – CSIC, 03550 San
Juan de Alicante, Alicante, SPAIN.


[08 / 06 / 2015]

Call: PreDoc FPI - Formación Personal Investigador MdM 4-year contract from the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness.

Qualification: Last year degree- or master student in computer science, mathematics, physics, chemistry or biochemistry, biotechnology with programming knowledge (python or other).

The Crystallographic Methods group (http://www.ibmb.csic.es/index.php?pg=laboratorio&idLaboratorio=24&tab=lab_home) at the Maria de Maeztu Excellence Unit of the Department of Structural Biology at the IBMB-CSIC (Barcelona Science Park, www.pcb.ub.edu), seeks a Master or Degree student to carry out an interdisciplinary project in the development of computing methods in Structural Biology within our software ARCIMBOLDO (http://chango.ibmb.csic.es/ARCIMBOLDO).
Predicting protein folding from the aminoacid sequence remains one of the missing holy grails of biology. After five decades of protein crystallography, we have achieved the three-dimensional characterization of over 100.000 macromolecular structures. Structure has shed unique insight into manifold biological questions, but despite the wealth of information gathered in the PDB database, our understanding of its essence is insufficient: we usually get an insight into the relation between the function and the geometry for a small part of the structure, regarding active or binding sites, etc... and as for understanding folding itself, our success in de novo prediction is very limited and at best uncertain.
 
The paradigm is shifting, blending detailed investigation of specialized aspects into global apprehension of complex systems. We need a tool to understand fold in its full scope. In analogy to Borges' story, an Aleph, a point in space that contains all other points. Anyone who gazes into it can see everything in the universe from every angle simultaneously, without distortion, overlapping or confusion.
In the field of crystallographic ab initio phasing we have developed within our program ARCIMBOLDO a successful algorithm for the extraction of tertiary structure constraints from all the structures in the PDB. It is based on the geometrical expression of polypeptide conformation through characteristic vectors, affording detailed and customizable analysis of main chain geometry and of the spatial relationship among structural elements.
Characteristic vectors and supercomputing will be the base of our particular Aleph, to explore local folds of noncontiguous protein fragments with a customizable level of detail and through them reconstitute the whole fold so as to simultaneously apprehend a detailed and an overall view. We want to probe our new algorithm to explore, through local fold, the problems of phasing, folding, functional interactions and lattice formation.
Information on our programs and publications can be read from our web:
http://chango.ibmb.csic.es/ARCIMBOLDO
 
Interested applicants, should contact Isabel Usón (uson@ibmb.csic.es), with an academic CV (detailing subjects and marks) and cover letter describing motivation and contact details for one or two potential references.
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Claudia Millán (cmncri@ibmb.csic.es)
Crystallographic Methods Group
http://chango.ibmb.csic.es
Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB-CSIC)
Barcelona, Spain
LinkedIn: es.linkedin.com/in/claudiamillan/
ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Claudia_Millan?ev=hdr_xprf

[28 / 05 / 2015]

University of California, San Diego
San Diego Supercomputer Center
Postdoctoral Fellow

Summary: We are looking for two highly motivated post-docs as part of our new project "Compressive Structural Bioinformatics" funded by the US National Institutes of Health (NIH) Big Data to Knowledge (BD2K) initiative.

The Challenge: To enable efficient research on the rapidly growing number of 3D molecular structures of ever increasing size and complexity. Develop highly scalable 3D structural search, analysis, workflow, data-exchange, and visualization tools.

Qualifications: Ph.D. in structural bioinformatics, structural biology, bioinformatics, computational biology or chemistry, computer science, or related discipline. Experience with scientific software development as demonstrated by publications or participation in open source software projects. Experience with several programming languages, including Java, JavaScript, C++, or Python, and software development tools. Strong skills in applied mathematics and algorithm design are required. Experience with distributed parallel computing or 3D visualization applications are a plus. Excellent interpersonal, written, and oral presentation skills are essential.

Note, this position is reviewed annually on the basis of performance and can be renewed for a maximum of three years.

Our Environment:

The Structural Bioinformatics Group (http://bioinformatics.sdsc.edu) at the San Diego Supercomputer Center (SDSC) (http://www.sdsc.edu) is involved in research and development activities centered around 3D structures of proteins and nucleic acids, the integration of structural data with other domains such as Medicine, Genomics, Biology, Drug Discovery, and the development of scalable solution to Big Data problems in Structural Bioinformatics. Our group leads the RCSB Protein Data Bank (PDB) west-coast operations. The RCSB PDB (http://www.rcsb.org) represents the preeminent source of experimentally determined macromolecular structure information for research and teaching in biology, biological chemistry, and medicine. With over 300,000 unique users from over 160 countries around the world, the RCSB PDB is one of the leading worldwide Biological Databases. Our group is involved in the National Institutes of Health (NIH) Big Data to Knowledge (BD2K) initiative.

As an Organized Research Unit of UC San Diego, SDSC is a world leader in data-intensive computing and cyber infrastructure, providing resources, services, and expertise to the national research community, including industry and academia.

To apply, please send cover letter and resume to Dr. Peter Rose (pwrose@ucsd.edu).
     


[11 / 05 / 2015]
         
The Computational Biology Group  @  Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (LCSB) seeks a highly skilled and motivated Bioinformatician. More info:

http://recruitment.uni.lu/en/details.html?id=QMUFK026203F3VBQB7V7VV4S8&nPostingID=4654&nPostingTargetID=6158&mask=karriereseiten&lg=UK



[05 / 05 / 2015]

Hay una convocatoria de 15 becas para realizar el doctorado en la Universidad de Padua, al menos una de ellas en bioinformática: http://www.unipd.it/en/node/1053



[05 / 05 / 2015]

OFERTA BECA JAE-INTRO 2015

Destinatarios:
A) Licenciados o graduados que hayan finalizado los estudios en el curso académico 2012-2013 o posterior, con una nota media igual o superior a 7,80 en la escala decimal de 0-10 y que hayan estado matriculados en un máster universitario oficial en el curso 2014-2015 o haber realizado la inscripción o pre-inscripción en un máster universitario oficial para el curso 2015-2016.

B) Estudiantes que aún no hayan finalizado los estudios de grado siempre que en el momento de la incorporación cumplan los requisitos de calificaciones mínimas e inscripción en el máster.

Duración: 2 meses, con inicio el 1o de octubre 2015.

Cuantía de la beca: 2.000€

Tema: SISTEMAS DEPENDIENTES DE FLAVOENZIMAS EN PLANTAS: APLICACIONES
BIOTECNOLÓGICAS

ref.: JAEINT_EX15_0310

Descripción: El estudiante se introducirá en la investigación en el campo de la
Biología Estructural y Computacional, y se familiarizará con el manejo de herramientas computacionales y bioquímicas para la identificación de modificaciones en el sitio activo de las flavoenzimas y de inhibidores selectivos de las mismas con potencial biotecnológico. Estos estudios se enmarcan en una
disciplina científica muy activa actualmente.

Contacto: Inmaculada Yruela Guerrero, i.yruela@csic.es, teléfono: 976 716058.
Dirección: Estación Experimental de Aula Dei (EEAD-CSIC), Avda. Montañana 1005, 50059 Zaragoza. http://www.eead.csic.es

Plazo solicitud: 6 al 25 de mayo 2015.

Documentación: https://sede.csic.gob.es/intro2015




[24 / 03 / 2015]

Bioinformatician - NGS data analysis

The Bioinformatics Department of Cetir Fundación Privada, which main focus is the analysis of Next-Generation Sequencing data (Whole genomes, TargetSeq, RNASeq), is looking for a Bioinformatician.
RESPONSABILITIES
Design and development of innovative analysis routines for the interpretation of NGS data.
REQUIREMENTS
We are seeking for a person with a scientific degree in a discipline with relevant content in Bioinformatics, Human Genetics and/or Molecular Genetics.
-Required skills: strong Human Genetics/Molecular Biology background, advanced Python, linux and R skills. Demonstrable experience in working with high-throughput biological datasets. Fluency in English is mandatory.
-Desired skills: Extensive experience in human gene/genome analysis and in automating scripts and bioinformatics pipelines.

HOW TO APPLY

Qualified candidates should submit a cover letter highlighting key qualifications and interests and curriculum vitae/resume via mail to rrhh@fundacioncetir.com



[ensembl-dev] Come and work with us

From: Emily Perry <emily@ebi.ac.uk>
Subject: [ensembl-dev] Come and work with us
Date: 24 March 2015 14:12:42 GMT

Hi Dev-ers
Just to let you know about a few jobs in and around Ensembl that are out. In order of closing date:

Resequencing Informatics Scientific Programmer
http://www.embl.de/jobs/searchjobs/index.php?newlang=1&ref=EBI_00516
RI works alongside Ensembl, supporting data coordination and analysis services for 'omics projects like International Genome Sample Resource (formerly 1000 Genomes), BLUEPRINT, HipSci, EBiSC and FAANG.
Closing 17th April

eHive Scientific Programmer
http://www.embl.de/jobs/searchjobs/index.php?newlang=1&ref=EBI_00514
Work within our Compara team on the eHive production pipeline.
Closing 19th April

Ensembl Outreach Officer
http://www.embl.de/jobs/searchjobs/index.php?newlang=1&ref=EBI_00511
Work with our Outreach team to aid scientists working with Ensembl, via international workshops, helpdesk emails, help pages, social media, e-learning and user experience.
Closing 30th April

--
Dr Emily Perry (Pritchard)
Ensembl Outreach Project Leader

European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)
European Molecular Biology Laboratory
Wellcome Trust Genome Campus
Hinxton, Cambridge
CB10 1SD
UK


Post-doctoral Position in Genomics and Bioinformatics

We are seeking an enthusiastic candidate who will develop and apply bioinformatics approaches to study metazoan DNA replication origins and their associated factors through the analysis of high-throughput genomic data. The ideal candidate should be finishing — or have recently finished — a PhD in bioinformatics, with experience in the analysis of Next Generation Sequencing data. The postdoc will develop computational methods for integrative analysis of next generation sequencing data, DNA sequence, epigenomic data and gene expression to construct and dissect origins of replications dynamics. The funding for this position comes from a grant by the French National Agency for Research
(ANR ORICHOICE) involving three French laboratories in Marseille and Montpellier. The postdoc will work closely with computational biologist at the TAGC laboratory (Benoît Ballester/Jacques van Helden group, Marseille, France), and collaborate with experimental investigators at the Institute of Human Genetics (Marcel Mechali group, IGH, Montpellier, France) and at The Institute of Molecular Genetics (Naomi Taylor group, IGMM, Montpellier, France). The research project gives access to unique unpublished high throughput datasets.


Qualifications
Applicants should have a Ph.D. degree in computational biology, bioinformatics, genomics or a related discipline (computer science, statistics, physics, and mathematics). The successful candidate should have experience in analyzing high-throughput genomic data and proven skills in using genomics/bioinformatics tools (Bedtools, Ensembl, etc.). Strong computer programming (Perl/Python, Java, R/bioconductor, Bash scripting) and analytical skills (good understanding of statistical methods for high-throughput data analysis) are essential. Experience with Linux environment is required and experience with computer clusters and job scheduler software will be a plus. An established track record (as evidenced as lead author in at least one publication in major peer-reviewed scientific journals) in biological sequence and genomic analyses is a significant plus.
Postdoc is expected to lead this project on a collaborative basis both within the team and with external collaborators of this grant. Good communication skills especially with experimentalist are a plus. Possible travel and stay in Montpellier for meetings.


About the TAGC
The TAGC Inserm laboratory U1090 (http://tagc.univ-mrs.fr) is located in Marseille, in the south of France, and is a multidisciplinary laboratory combining research topics in immunology, genomics, developmental biology, systems biology and bioinformatics.

Job Information
Position Type: Postdoctoral Researcher
Start Date: September 2015
Duration: 24 months
Salary: Following Inserm payscale according to profile and experience.

Contact Information:
Prof. Jacques van Helden Jacques.van-Helden@univ-amu.fr
Dr. Benoit Ballester benoit.ballester@inserm.fr

How To Apply:
Interested candidates should email to Prof. van Helden and Dr. Ballester:
• a CV
• a cover letter stating research interests
• qualifications
• contacts of two or three referees.



[09 / 02 / 2015]

Principal Scientist - Structural Biologist/Molecular Modeling
The Department of Haemophilia Biochemistry is seeking an experienced scientist for structure-guided protein optimization and design.
URL: 
http://www.novonordisk.com/careers/job_section/jp.asp?jobid=26462BR&joblng=uk&jobcnt=Denmark&type=1a
 



[26 / 01 / 2015]

Stellenbosch University, South Africa 
---
The Evolutionary Genomics Group at Stellenbosch University has a post-doctoral position available in the Department of Botany and Zoology to investigate the origin, structural organization (architecture) and genomic plasticity of the meiotic genomes of African antelope. Large-scale chromosomal changes such as inversions, translocations, fusions and fissions “reshuffle” genomic segments providing new chromosomal forms on which natural selection can work. Since these new forms are produced in the germ line they can, at least potentially, be fixed in populations thereby providing new heritable allelic variants that are essential for the maintenance of genetic diversity (Heredity 108 (1): 28-36).
 
The ideal candidate will have a published track record in molecular cytogenetics, especially in meiosis. A strong background in one or more the following areas would be advantageous:
• comparative genomics
• molecular systematics
• bioinformatics
 
The incumbent will work closely with researchers in two other groups: Dr Aurora Ruiz-Herrera (Universitat Autònoma de Barcelona, Spain, http://grupsderecerca.uab.cat/evolgenom/) and Professor Jiri Rubes (Veterinary Research Institute, Czech Republic) but will be located in the Stellenbosch lab. The appointment is for one year with the possibility of renewal contingent upon satisfactory progress. Salary is competitive but benefits are not included. This position is available immediately.
 
Expressions of interest should be sent to Terry Robinson (tjr_a_sun.ac.za) and should include the names and contact details of 2-3 referees, a full CV and a covering letter that highlights the appropriateness of your expertise and why you are interested in the position.
 


[23 / 01 / 2015]

The CNIC Genomics Unit is searching for a motivated candidate to apply for a 2-year Juan de la Cierva-“Formación” Contract.

To be eligible candidates will have obtained their PhD degree between January
2013 and December 2014. Due to the competitiveness of the program, candidates will need to have at least one first-author publication in a leading journal. Experience in molecular biology is required. Experience in bioinformatics and Genomics/Genetics will be acknowledged. The candidate will study the genome and the transcriptome at the single-cell level by applying Next Generation Sequencing technologies, and will follow closely the advances in new technologies for high-throughput nucleic acid analysis.

Applicants must submit CV, research interest and contact information
for 2-3 references to Ana Dopazo as soon as possible.

Formal application deadline ends 29/01/2015:

adopazo_a_cnic.es

FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA DEL HOSPITAL CLÍNICO SAN CARLOS
 
Contrato a través de convocatoria pública en régimen de concurrencia competitiva para trabajar como investigador en el Proyecto: “Red de Investigación en Inflamación y Enfermedades Reumáticas (RIER). RD12/0009/0011” en la Unidad de Reumatología del Hospital Clínico San Carlos.
Este contrato se iniciará previsiblemente en el mes de Febrero y durará, como máximo, hasta la finalización de las funciones del contratado en el Proyecto y en todo caso, hasta el agotamiento o cancelación de la financiación recibida para el mismo, siendo la duración prevista hasta el 31/12/2015.


El plazo de presentación de solicitudes comenzará el día 20 de enero de 2014 y finalizará el día 31 de enero de 2015.



El grupo del profesor Javier Martín Ibáñez está buscando un candidato para solicitar una beca FPU.
Fecha de fin de presentación de solicitudes: 6 de Febrero de 2015
Requisitos: 
Licenciatura o Grado en Biología, Bioquímica o similar.
Conocimientos de Bioinformática.
Máster universitario en ciencias de la salud o similar.
Lugar de trabajo:
Laboratorio de "Bases Genéticas de las enfermedades autoinmunes". 
Instituto de Parasitología y Biomedicina López-Neyra (CSIC)
Granada
Interesados mandar CV a: arturoraist_a_gmail


[08 / 01 / 2015]
Ensembl is hiring! We are looking for a total of three talented computational biologists, computer scientists, software developers or bioinformaticians.

Position 1: Ensembl Regulation
This position is focused on turning the latest epigenomic datasets into functional features such as promoters and enhancers, and working closely with the Centre for Therapeutic Target Validation project. A link to the full job description including required programming and technical skills is here:
http://www.embl.de/aboutus/jobs/searchjobs/index.php?newlang=1&ref=EBI_00477

Deadline for applications: Tuesday 20 January
Direct questions about the position should be addressed to Daniel Zerbino (zerbino@ebi.ac.uk)

Positions 2 and 3: Ensembl Comparative Genomics
There are two positions in Ensembl Compara.  One is focused on TreeFam and the Ensembl Gene Trees and the other developing support for the whole genome alignments within Ensembl.  Both positions will respond to the challenge and excitement of the hundreds of new genomes now being sequenced.

Links to the full job descriptions including required programming and technical skills are here:
http://www.embl.de/aboutus/jobs/searchjobs/index.php?newlang=1&ref=EBI_00478
http://www.embl.de/aboutus/jobs/searchjobs/index.php?newlang=1&ref=EBI_00480

Deadline for applications: Friday 30 January
Direct questions about the position should be addressed to Matthieu Muffato (muffato@ebi.ac.uk)

These posts feature and a competitive salary and an initial three year contact.



[18 / 12 / 2014]
postdoc en bioinformática estructural en el Biological Magnetic Resonance Data Bank en Wisconsin (USA)
URL: [http://www.bmrb.wisc.edu/bmrb/news/]




[11 / 12 / 2014]
3 postdocs en bioinformática en Florida (USA)
URL: [http://bioinfo.cipf.es/aconesawpURL/?p=995]





[02 / 12 / 2014]
2 contratos para bioinformáticos en Pamplona (España)
URL: [https://www.cima.es/trabaja-en-cima/ofertas]





 [28 / 11 / 2014]

OFERTA DE BECA-CONTRATO PREDOCTORAL ASOCIADA A PROYECTO DE INVESTIGACIÓN DE EXCELENCIA. JUNTA DE ANDALUCIA

(Procedimiento de selección de personal investigador EN FORMACIÓN correspondientes a los proyectos de investigación de excelencia incentivados a las universidades y organismos de investigación de Andalucía. Convocatoria 2012).

Título del Proyecto: SISTEMAS DE CÓMPUTO AVANZADOS EN APLICACIONES DEL ÁMBITO DE BIOTECNOLOGÍA Y BIOINFORMÁTICA.
Código del Proyecto: 2082 (Dentro Listado de Proyectos de Investigación de Excelencia de la convocatoria de 2012 con Personal Investigador en Formación).
Organismo: Universidad de Granada
Responsable: Prof. Ignacio Rojas Ruiz
Duración: 4 años
Posibilidad de realizar estancias en el extranjero:
En el siguiente enlace se puede consultar los importes máximos de la concesión de ayudas para estancias:
Plazo: El plazo de presentación de solicitudes es de 15 días hábiles contados a partir del día siguiente a la publicación en BOJA de la resolución del procedimiento de selección de fecha 24 de noviembre de 2014.

Instrucciones para presentar solicitud: En el siguiente enlace se indican las instrucciones para la presentación de solicitudes. http://www.juntadeandalucia.es/export/drupaljda/INSTRUCCIONES%20PRESENTACI%C3%93N%20SOLICITUDES%20PIF%202012.pdf


           Este es  un proyecto de carácter multidisciplinar y ese carácter se manifiesta en la composición del equipo investigador que está  formado por especialistas en procesamiento de datos, computación de altas prestaciones y bioinformática/biomedicina, junto con personal experto de  instituciones extranjeras y personal experto de empresas. Para más información del proyecto y de sus objetivos, contacte con: irojas@ugr.es.
Más información sobre la solicitud de la beca se encuentra disponible en:

En el siguiente enlace se especifican los requisitos que deben tener los candidatos en anteriores convocatorias:
Quinto. Documentación. En la solicitud de incentivo a la formación al personal investigador deberá acompañarse de la siguiente documentación:
a) Currículum vitae.
b) Título Oficial de los estudios cursados o resguardo de haberlo solicitado.
c) Certificación académica oficial, en la que figuren de forma detallada las calificaciones obtenidas, fechas de las mismas, constancia expresa de que las materias constituyen el programa completo de la titulación correspondiente y la media del expediente académico. En el caso de titulaciones obtenidas en las universidades españolas dicha media se calculará conforme a lo establecido en el Acuerdo de 6 de febrero de 2012 (BOJA núm. 42, de 1 de marzo de 2013), de la Comisión de Distrito Único Universitario de Andalucía, sobre el procedimiento del cálculo de notas medias de los expedientes universitarios.
d) Documentación acreditativa de estar admitido al periodo de investigación de un programa de doctorado o documento que acredite el compromiso de aportar dicha admisión antes de dictar la resolución de concesión en el caso de ser seleccionado. (En caso de duda sobre este apartado puede solicitar información adicional escribiendo un correo al Prof. Hector Pomares, con dirección: hector@ugr.es)
e) Copia del pasaporte en vigor, en el caso de ciudadanos extranjeros no residentes en territorio español.
f) Título oficial de Especialidad Médica (MIR) o Farmacéutica (FIR) o Certificado oficial de Especialidad en Biología, (BIR), en Química (QUIR) o Psicología (PIR) en el caso de que las personas solicitantes posean alguna o algunas de las citadas titulaciones.
g) Libro de familia, en el caso de que las personas solicitantes se encuentren en el supuesto de cuidado de hijos y/o documentación acreditativa de la grave necesidad en caso cuidado de familiares.
h) Certificado de la ONG o de la empresa donde hayan prestado sus servicios y vida laboral en su caso.
i) Certificación acreditativa del grado de discapacidad, en su caso.


Para más información, puede enviar un correo a: irojas@ugr.es


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Ignacio Rojas Ruiz
E.T.S. Ingenierías Informática y de Telecomunicación
Dpto. Arquitectura y Tecnología de Computadores
C/ Periodista Daniel Saucedo Aranda s/n Universidad de Granada
E-18071 GRANADA (Spain)
Phone: +34-958242894
Fax: +34-958- 24 89 93