tag:blogger.com,1999:blog-1320528867223721914.post8541203347739777378..comments2024-03-18T10:00:22.981+01:00Comments on #!/perl/bioinfo: Eliminar secuencias redundantes y transcritos repetidos (II, con CD-HIT)brunocontrerashttp://www.blogger.com/profile/06780659979139333360noreply@blogger.comBlogger3125tag:blogger.com,1999:blog-1320528867223721914.post-10333221005076784792016-06-15T11:35:42.633+02:002016-06-15T11:35:42.633+02:00Otra opción más reciente:
https://github.com/soedi...Otra opción más reciente:<br />https://github.com/soedinglab/MMseqs<br />http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/32/9/1323.fullbrunocontrerashttps://www.blogger.com/profile/06780659979139333360noreply@blogger.comtag:blogger.com,1999:blog-1320528867223721914.post-83384144426427364642012-06-19T09:12:44.132+02:002012-06-19T09:12:44.132+02:00Hola anónimo, al eliminar redundantes probablement...Hola anónimo, al eliminar redundantes probablemente estés eliminando muchos parálogos, pero ten en cuenta que lo harás con un criterio fijo de % de identidad de secuencia; todos aquellos parálogos que tengan menos identidad sobrevivirán, no sé si me explico, Brunobrunocontrerashttps://www.blogger.com/profile/06780659979139333360noreply@blogger.comtag:blogger.com,1999:blog-1320528867223721914.post-85588804441331370202012-06-19T04:24:51.764+02:002012-06-19T04:24:51.764+02:00CD-Hit se puede utilizar para eliminar secuencuas ...CD-Hit se puede utilizar para eliminar secuencuas paralogas o duplicadas del proteoma de una sola sp o de la comparacion de dos sp, por ejemplo de un patogeno y su hospedero?Anonymousnoreply@blogger.com